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Nature Biotechnology:m6A定量测序新方法 | 何川、陈建军、陈梦洁、胡璐璐等合作开发

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2024-08-24 21:00

主要观点总结

本文介绍了mRNA表观修饰中m6A修饰的研究进展,包括其影响细胞功能和命运决定的作用。文章详细描述了m6A修饰的发现、化学修饰的种类、作用机制以及最新的m6A-SAC-Seq技术的应用和发展。这项新技术能够在单碱基分辨率水平追踪m6A分布和含量的动态变化,在基础生物学研究和临床应用中具有广泛的应用前景。

关键观点总结

关键观点1: mRNA表观修饰中m6A修饰对细胞功能和细胞命运决定的重要性。

m6A修饰是哺乳动物mRNA内部最主要的修饰形式,通过影响mRNA的代谢过程如剪接、出核、降解和翻译等调控基因表达。

关键观点2: m6A修饰的研究进展。

早期的研究主要关注m6A修饰的“书写者”、“擦除者”和“识别者”,近年来陆续开发新的m6A测序方法,如m6A-SAC-Seq技术,能够覆盖几乎所有的m6A经典基序,并对捕获的m6A位点进行单碱基分辨率的定量分析。

关键观点3: m6A-SAC-Seq技术的应用和发展。

m6A-SAC-Seq技术不依赖于抗体,可以实现对微量RNA样本的m6A位点分析,并在单碱基分辨率水平追踪m6A分布和含量的动态变化。该技术已应用于细胞分化、早期发育、神经元信号传导等领域,并展示了广泛的应用前景。


文章预览

以往认为中心法则中DNA主要发挥模板的作用而信使RNA(mRNA)则扮演着信息传递者的角色。mRNA表观修饰的发现拓展了mRNA的功能。在RNA水平上的转录后修饰可通过顺式或者反式机理调控基因表达,对细胞功能、细胞命运决定至关重要。尽管科学家们长时间以来了解RNA上存在转录后修饰,而这些修饰直到近年来才被认为从另一层面增加了基因表达调控的复杂性。 迄今为止,RNA上共发现有多于150种化学修饰,包括m6A、m1A、pseudouridine、m5C等(图1)。这些修饰在“表观转录组”这一新颖且关键的层面调控基因的表达。 图1:mRNA常见的集中化学修饰,包括m6A、m1A、pseudo uridine(ψ)、m5C等。 m6A是mRNA内部含量最多,也是迄今研究最广泛的修饰6。m6A修饰最早发现于1974年,是哺乳动物mRNA内部最主要的修饰形式1,早期的研究工作表明m6A通常出现在(G/A)(m6A)C经典序列中 ………………………………

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