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空间组学 | 用 moscot 对细胞进行时空动态分析

生信菜鸟团  · 公众号  · 生物  · 2025-03-06 09:35
    

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Basic Information 英文标题:Mapping cells through time and space with moscot 中文标题:通过时间和空间映射细胞 with moscot 发表日期:22 January 2025 文章类型:Article 所属期刊:Nature 文章作者:Dominik Klein | Fabian J. Theis 文章链接:https://www.nature.com/articles/s41586-024-08453-2 Abstract Para_01 单细胞基因组技术使我们能够在时间和空间维度上对数百万个细胞进行多模态分析。 然而,实验限制阻碍了我们在天然时间动态下和在其天然空间组织微环境中全面测量细胞的能力。 最优传输作为一种强大的工具已经出现,解决了这些限制,并促进了原始细胞环境的恢复1,2,3,4。 然而,大多数最优传输应用无法整合多模态信息或扩展到单细胞图谱。 在这里,我们介绍了multi-omics单细胞最优传输(moscot),这是一种可扩展的框架,用于单细胞基因组学中的最优传输,支持所有应用中的多模 ………………………………

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