读书笔记 24-5 | 第10部分 | 微阵列数据的通路富集分析

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书名 ：Microarray Data Analysis 编辑 ：Giuseppe Agapito 年份 ：2022 出版社 ：HUMAN PRESS ISBN ：ISBN 978-1-0716-1839-4 Pathway Enrichment Analysis of Microarray Data 作者 Chiara Pastrello, Yun Niu, and Igor Jurisica 摘要 微阵列分析 通常产生一个差异基因列表，这些基因需要进行注释以： 链接到所研究的表型 帮助规划验证实验 解释结果 通路富集分析 经常用于上述目的，其中通路是 人工创建的分子活动和过程模型 。 虽然有不同类型的通路富集分析可用，本协议 重点介绍最常见的类型——过度表示分析 数据库多样性 ： 许多数据库收集不同的通路集 为相同的通路策划不同的基因集 因此，选择最合适的通路来源进行富集分析非常重要 综合通路分析工具 ： 本协议将使用 pathDIP pathDIP整合了 22个主要通路数据库 支持全面的富集分析 可视化步骤 ： 描述使用 GSOAP 进行富集通路可视化的步 ………………………………