Bioinformatics｜东南大学多个团队合作推出空间转录组数据质控新工具SpatialQC

文章预览

2024年7月25日，来自 东南大学的谢芃研究员和林承棋、罗卓娟教授领衔的研究团队， 在权威生物信息学期刊 《Bioinformatics》 上发表了题为 “SpatialQC: automated quality control for spatial transcriptome data” 的研究论文。 该研究的核心贡献在于开发了SpatialQC这一创新工具，填补了当前空间转录组数据分析流程中缺乏一站式质控（QC）工具的空白，并进而促进了数据质量的提升与分析流程的简化。 空间转录组学的出现揭示了生物组织内部的空间异质性，极大地推进了为我们对细胞间及分子间相互作用机制的深层次理解。 在空间转录组学领域内，数据的质量控制（QC）是影响数据分析准确性、可靠性乃至科学结论有效性的关键环节。 当前，空间转录组数据分析流程普遍缺乏一个综合性的、一站式QC工具，以系统地评估和优化数据质量，这限制了数据处理过程的效 ………………………………