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AlphaFold 3预测D-肽翻车!杜克大学团队揭秘:AI竟然“误判”手性,高达 51% 预测像是在掷硬币?

Dots机构投资者社区  · 公众号  ·  · 2025-03-24 08:15
    

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本文转自微信公众号“BioTender”,作者:Max。 近年来,随着 AlphaFold 系列模型的不断突破,AI在蛋白质结构预测上的应用取得了巨大进展。然而,杜克大学化学、计算机科学与生物化学等多个学科的跨学科团队,近期在一项研究中揭示: AlphaFold 3在D-肽预测上存在严重缺陷,平均手性错误率高达 51%,几乎与随机猜测无异!  这一发现对D-肽药物设计领域提出了重要警示。 D-肽是什么?为什么它这么重要? 在天然生物体系中,绝大多数蛋白质由 L-氨基酸 组成,而 D-肽 则是由 L-氨基酸的镜像形式——D-氨基酸构成。D-肽因其 抗蛋白酶降解、稳定性高、膜渗透性强 等优势,在 抗菌肽、抗癌肽和神经肽药物 研究中备受关注。然而,想要高效设计D-肽,准确的 结构预测  是关键。如果AI工具能正确预测D-肽的折叠方式和靶点结合模式,D-肽药物的研发效率将 ………………………………

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