北京生物结构前沿研究中心由清华大学与北京市科学技术委员会联合共建,成立于2018年,中心主任为施一公教授,执行主任为王宏伟教授。作为北京市构建高质量发展新范式的新型研发机构,中心致力于开展关键核心技术攻关和从0到1基础科学难题突破。
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胡名旭及合作者提出基于自监督轨迹的预测冷冻电镜稀有构象高分辨率密度图的新算法

北京生物结构前沿研究中心  · 公众号  ·  · 2024-11-07 09:36
    

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生物大分子的功能主要由其构象转变所驱动。阐明生物大分子在不同构象状态下的结构,能有效帮助我们理解这些分子发挥功能的结构基础。在各种技术中,冷冻电镜 (cryo-EM) 已被证明是一种强大的工具,能够以原子或近原子分辨率对生物大分子进行结构解析。这项技术能够在毫秒内快速玻璃化生物样本,故而理论上能捕捉生物大分子在不同构象状态下的结构。 然而,根据动态平衡定律 (law of dynamic equilibrium) ,生物大分子处于不同构象状态的占比存在显著差异。在许多案例中,处于低能态的常见构象在生物大分子颗粒中的数量较多,因而能够获得高分辨率的密度图;而稀有构象处于较高能量的准稳定状态,所以在平衡条件下颗粒稀少。尽管后者对揭示关键生物过程至关重要,却往往难以达到满意的分辨率。如何提升这些稀有构象的分辨率, ………………………………

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