专栏名称: 生信分析手册
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5+双硫死亡LncRNA+预后模型+PCR,这个思路爽翻了,现成基因集,复现即躺赢!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-09-03 18:36

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章" Disulfidptosis-associated LncRNA signature predicts prognosis and immune response in kidney renal clear cell carcinoma" ,这篇文章发表在Biol Direct 期刊上,影响因子为5.7。 结果: KIRC 患者的数据 研究方案流程图见图 1 。共 532 例 KIRC 患者按 7:3 的比例分为训练集(373 例)和测试集(159 例)。训练集的患者数据用于识别预后DRlncRNA并建立预后模型,而测试集的患者数据用于验证模型的准确性。两组患者在年龄、性别、分级或 TNM 分期等临床特征方面无明显差异 ( P > 0.05)(表 2 )。 基于 DRlncRNA 预测 KIRC 预后的风险模型 作者从文献中获得了10个二硫化相关基因。然后,利用皮尔逊相关系数法分析了TCGA数据库中的lncRNA与二硫化相关mRNA之间的相关性,共鉴定出431个DRlncRNA(表S1)。如图2A所示,Sankey图显示有10个二硫化相关基因和431个DRlncRN ………………………………

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