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基于药效团与GPT从头生成分子,北大开发TransPharmer助力药物发现

ScienceAI  · 公众号  ·  · 2025-03-11 11:50
    

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将  ScienceAI   设为 星标 第一时间掌握 新鲜的 AI for Science 资讯 编辑 | 萝卜皮 深度生成模型推动了药物发现,但生成的化合物通常结构新颖性有限,限制了药物化学家的灵感。 为了解决这个问题,北京大学的研究人员开发了 TransPharmer,这是一种生成模型,它将基于配体的可解释药效团指纹与基于生成预训练 Transformer(GPT)的框架相结合,用于从头生成分子。 TransPharmer 在无条件分布学习、从头生成和药效团约束下的骨架构建方面表现出色。其独特的探索模式可以增强骨架跳跃,生成结构不同但药理学相关的化合物。这为发现结构新颖且具有生物活性的配体提供了一种有前途的工具。 该研究以「 Accelerating discovery of bioactive ligands with pharmacophore-informed generative models 」为题,于 2025 年 3 月 10 日发布在《 Nature Communications 》。 识别具有针对目标生物活 ………………………………

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