【Nature子刊】窥探细胞内的秘密世界：浙江大学药学院程翼宇团队利用scCube，揭示转录组学中的多重变异性！

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本文为转化医学网原创，转载请注明出处  作者：Tracy 【导读】 空间分辨转录组学（SRT）的一个紧迫挑战，是计算方法的基准测试。一种广泛使用的方法，涉及利用模拟数据。然而，目前可用的模拟SRT数据存在偏差，严重影响了方法评估和验证的准确性。本研究提出了scCube，这是一个Python包，用于对SRT数据进行独立、可重复和技术多样化的仿真。scCube不仅可以在基于参考的模拟中，保留基因的空间表达模式，还可以在无参考模拟中，生成具有不同空间变异性的模拟数据（包括空间模式类型、分辨率、斑点排列、目标基因类型和组织切片维度等）。 近日， 浙江大学药学院程翼宇团队在期刊《Nature Communications》上发表了题为“Simulating multiple variability in spatially resolved transcriptomics with scCube”的研究论文。在本研究中，团队提出了一个空间分辨转录组学 ………………………………