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多样本单细胞数据分析(多种差异分析)

生信狂人团队  · 公众号  ·  · 2024-10-21 09:37
    

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随着单细胞测序的价格不断下降,单细胞测序的样本数量不断增加,越来越多, 这个时候就需要考虑将多个样本数据进行合并分析,差异分析的条件就有更多的选择,可以满足更多的科研目的,无论是你发文章、开题、申请课题都是非常多的思路。 做分析的时候需要批量读入每一个样本的单细胞数据,然后合并、去除批次效应 然后进行数据过滤、降维、聚类 细胞类型注释 差异分析(细胞之间的差异分析, 同一类细胞在不同组之间的差异分析),这里就有多种条件进行差异分析,得到的差异基因也会不一样,更加容易得新的靶点,书写新的故事,这样一个课题就来了。 根据上面的差异基因,我们就可以结合之前的eqtl、pqtl、共定位、SMR进行分析,筛选新的靶点发文章,同时你也可以用来作为开题、申请课题的前期基础。 不过,样本多了也是有明 ………………………………

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