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教程目录 教程地址:https://www.tidymass.org/docs/chapter5/1-data_explore/ 数据准备 下载示例数据并参考这篇文章。 我们有正离子模式和负离子模式。对于每种模式,我们有对照组、病例组和 QC 组。对照组有 110 个样本,病例组也有 110 个样本。 |625 正离子模式 massprocesser 包用于进行原始数据处理。请参考[此网站](file:///Users/xiaotaoshen/tidymass/massprocesser/docs/index.html)。 代码 用于原始数据处理的代码: library (tidymass) process_data( path = "mzxml_ms1_data/POS" , polarity = "positive" , ppm = 10 , peakwidth = c( 10 , 60 ), threads = 4 , output_tic = FALSE , output_bpc = FALSE , output_rt_correction_plot = FALSE , min_fraction = 0.5 , group_for_figure = "QC" ) 结果 所有结果将放置在 mzxml_ms1_data/POS/Result 文件夹中。更多信息请参见此处。 你可以直接加载该对象-object,它
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