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NAR | 港城大李帅成团队开发水平基因转移检测新算法,揭示肠道微生物水平基因转移和CRC的功能关联

测序中国  · 公众号  ·  · 2024-06-28 14:12

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2024年6月17日,香港城市大学计算机系 李帅成课题组 在 Nucleic Acids Research 上在线发表了题为“Enhancing insights into diseases through horizontal gene transfer event detection from gut microbiome”的文章。 研究团队开发了在肠道微生物中快速检测水平基因转移(HGT)的软件LocalHGT,并应用该软件揭示了HGT和疾病的功能关联,发现HGT作为生物标记可有效提高疾病预测准确率 。这一研究深化了对人体肠道中复杂HGT事件的理解,也为微生物组研究提供了新的研究方法和分析视角。 HGT是指在不同有机体之间所进行的遗传物质的交流。 HGT对微生物的进化和环境适应性非常重要。 HGT可以促进耐药基因和致病因子在微生物之间的传播。 人体肠道中有大量的HGT事件,它们跟人体的健康息息相关。 然而,我们对肠道中HGT的认识还很有限,这由于缺乏可靠的肠道HGT检测软件。 传统的HGT检 ………………………………

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