【技术专栏】水稻指纹图谱库的构建及应用

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指纹图谱库的构建 基于对水稻3k基因组（https://cgm.sjtu.edu.cn/3kricedb/）数据的挖掘和分析，筛选到了163个SNP分子标记，用于区分不同的水稻品种。对这163个标记位点设计引物，混成一管，形成了163重的引物panel。利用多重PCR技术，将163重的引物panel对水稻进行多重PCR扩增，然后建库测序，用来快捷高效地鉴定不同的水稻品种和绘制植物图谱。 基于该方法，我们对300多种水稻品种进行了多重PCR扩增和建库测序分析，绘制了如图1所示的300种水稻品种的指纹图谱。 图1 300种水稻图谱指纹热图。 指纹图谱的应用 水稻品种的区分与鉴别 为了验证构建的水稻指纹图谱库的准确性，测试了日本晴品种，编号分别是RB_1、RB_2和RB_4，利用同样的方法，利用这163个分子标记绘制了3个测试日本晴品种的指纹，然后与数据库进行比对，发现与数据库中CX140相似性最高，如图2 ………………………………