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空间转录组技术应用方向解析

玩转ATGC  · 公众号  ·  · 2024-11-19 08:09
    

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             『空间转录组学第三弹』 这次要介绍的空间转录组主题的文章题目是“Spatiotemporal transcriptomic atlas of mouse organogenesis using DNA nanoball-patterned arrays” 这篇文章是华大参与发表的,文章介绍了他们的时空转录组技术Stereo-seq,就是和国外的10X genomics对标的国产的空间转录组检测技术。 在这篇文章中,使用这个技术分析了来自小鼠胚胎时间跨度为E9.5至E16.5的53个小鼠胚胎切片,每个时间点间隔为一天。 这些切片覆盖了小鼠胚胎的所有主要组织和器官,包括皮肤、骨骼、肌肉、神经系统、心脏、肺、肝脏、肾脏等。 作者利用这53个空间转录组切片构建的一个全景和高分辨率的转录组资源库,叫做MOSTA,意思是Mouse Organogenesis Spatiotemporal Transcriptomic Atlas(小鼠器官发生时空转录组图谱)。 这个图谱详细记录了小鼠器官发生过程中组织特异性细胞 ………………………………

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