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环境因子分析如何做?轻松“拿捏”!

基迪奥生物  · 公众号  ·  · 2024-09-28 11:00
    

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环境因子分析 在微生物群落研究里常用于对物种差异的潜在关联因素做进一步讨论。环境变量信息的结合不仅可以帮助评估样本分组及分型情况,还可以利用环境因子辅助筛选差异标记物,以便实际应用模型可以得到最优构建。 文章中常用的关联模型非常多,比如CCA、RDA、Mantel tests等,可以对应散点图、网络图等图形。那么这些模型有何区别?又该如何选择可视化图形呢? 基迪奥Omicsmart微生物在线分析平台 中的环境因子分析工具包含 CCA分析、RDA分析、相关性热图、相关性网络图、网络热图、Mantel test、环境贡献度分析 ,用户可自由切换挑选需要的分析模型,快速进行数据挖掘。 RDA/CCA分析 CCA和RDA是探讨样本-物种-环境因子三者的关系。RDA/CCA分析,可以将样本和环境因子反映在同一个二维排序图上,从图中可以直观地反映样本分布与环境因子间 ………………………………

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