GRATCR：使用数据高效的预训练模型生成表位特异性TCR序列

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TCR在许多靶向肿瘤细胞的免疫疗法中发挥着至关重要的作用。然而，它们的获取和优化带来了重大挑战，涉及费力且耗时的湿实验资源。深度生成模型在功能性蛋白质序列生成方面表现出显著的能力，为增强特异性TCR序列的获取提供了有前途的解决方案。在这里， 上海交通大学熊毅研究团队 提出GRATCR，这是一个通过新型“嫁接”策略整合了两个预先训练的模块的框架，以从头生成靶向特定表位的TCR序列。 实验结果表明，与最先进的模型相比，通过使用明显更少的训练数据， GRATCR生成的TCR对所需表位表现出更高的特异性，并且具有更强的生物学功能 。此外，与天然序列相比，生成的序列显示出新颖性，可解释性评估进一步证实了该模型能够捕获重要的结合模式。GRATCR可在 https://github.com/zhzhou23/GRATCR 上免费获取。 T细胞是免疫系统不可或缺的一部 ………………………………