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微生物在食品科学历史中发挥重要作用,人类一直面临着微生物导致的食物中毒和腐败带来的危害。食品中的生物多样性水平参差不齐,从单一的微生物联到复杂的微生物群落,表征食品微生物组对理解其对人类健康的影响至关重要。近期研究显示,个体间微生物传播并非微生物组多样性的唯一来源,食物中的微生物可能成为人类微生物组的一部分,因此,需要在人群规模和菌株水平上对食物与人类微生物组的重叠情况进行全面调查。 基于此,意大利特伦托大学研究团队整合1950个新测序和583个公开可用的食物微生物组, 开发了可开放获取的curated Food Metagenomic Data(cFMD)资源,生成了10899个宏基因组组装基因组(MAGs),涵盖1036个原核生物和108个真核生物物种水平基因组箱(SGBs),其中包括320个未知物种。将这些MAGs与19833个人类宏基因组数据进行
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