专栏名称: 生信分析手册
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4+单基因+单细胞+分子对接,单基因分析就是这么灵活、加点实验分数会更高,还能不心动?

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-09-18 18:00

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ LHFPL2 Serves as a Potential Biomarker for M2 Polarization of Macrophages in Renal Cell Carcinoma”,这篇文章发表在 Int J Mol Sci 期刊上,影响因子为4.9。 结果: KIRC 中 LHFPL2 上调和临床相关性分析 本研究的整体工作流程如下所示图1.巨噬细胞的比例因不同的恶性肿瘤而异。鉴于巨噬细胞在肝癌、肾癌和胃癌中的富集程度较高,作者将巨噬细胞M2极化相关基因集的基因集变异分析(GSVA)评分指定为M2评分。作者根据M2评分的中位数将癌症样本分为高组和低组,然后观察每组中各种M2相关基因的表达水平,识别差异基因并挑选出LHFPL2作为靶基因(补充图S1)。对癌症基因组图谱 (TCGA) 的测序数据和临床信息的分析显示,与正常样本相比,某些癌症中 LHFPL2 转录水平显着上调,在肾透明细胞癌 (KIRC) 中尤为明显 (图2采用ROC曲线评估 ………………………………

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