专栏名称: 生信分析手册
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5+细胞衰老+PPI+qPCR,不踩雷,模仿就对了!只有一个简单实验验证!!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-07-12 10:34

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ Identification of hub genes and pathways associated with cellular senescence in diabetic foot ulcers via comprehensive transcriptome analysis”,这篇文章发表在 J Cell Mol Med 期刊上,影响因子为5.3。 结果: DEGs 的鉴定 该研究的研究流程图如图1所示。在对微阵列数据进行归一化后,在GSE80178中检测到3526个差异表达基因(DEGs)(图2A)。通过维恩图分析,作者在GSE80178和CellAge数据库中确定了66个重叠的CS-DEGs(图2B)。这66个CS-DEGs的表达热图能够有效区分DFU和DFS(图2C)。附表S1提供了这些重叠的CS-DEGs的详细信息。 功能分析 GSEA鉴定出的前五个富集项目是RNA代谢、细胞周期、有丝分裂细胞周期、带有帽子的内含子预mRNA的加工以及细胞器的生成和维持(图3A)。为了分析参与CS-DEGs的生物功能和通路,进行了GO和KEGG通路富集分析。GO分析结果显示 ………………………………

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