Nature撤稿 | 别再用这篇文章的TCGA微生物数据了

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2020年3月11日，来自加州大学圣地亚哥分校的Rob Knight团队在Nature杂志上发表了一篇题为Microbiome analyses of blood and tissues suggest cancer diagnostic approach的文章，他们通过对包含33种癌症共18116个样本癌症基因组图谱（TCGA）的全基因组和全转录组测序结果的分析，提出微生物DNA特征与大多数癌症类型之间存在强相关性，并创建一种机器学习模型作为基于微生物组的肿瘤诊断工具。 然而，时隔四年，来自约翰霍普金斯大学的Steven L. Salzberg等对该文章的数据分析及研究结论提出质疑，他们指出该文章报告与癌症相关的大多数微生物根本不存在于人类样本中，该研究数据及之后以此为基础的十余项后续研究结果可能是无意义的。 具体原因，见推文： Nature撤稿 | 时隔四年撤稿：微生物组与癌症类型存在相关性是数据分析错误所致 别再用这篇文章的微生物数据了 ………………………………