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Nat Commun|准确性达93.7%!高度自动化临床mNGS检测可快速识别病毒性呼吸道病原体

测序中国  · 公众号  ·  · 2024-11-27 15:30
    

主要观点总结

文章介绍了新一代宏基因组测序(mNGS)在临床检测中的研究与应用。开发了一种高度自动化的mNGS检测方法,用于快速识别新型和/或新发病毒,特别是针对呼吸道感染的病毒病原体。该方法具有良好的性能特征,并已经过验证和批准在临床实验室使用。

关键观点总结

关键观点1: 新一代宏基因组测序(mNGS)是一种全面且无偏倚的诊断方法,用于鉴定不明原因感染的病原体。

mNGS可用于鉴定所有潜在病原体,无需特定引物和探针。

关键观点2: 研究团队开发了一种高度自动化的mNGS检测方法,周转时间少于24小时,可用于识别常见和新型病毒性呼吸道病原体。

该方法与金标准临床多重RT-PCR检测相比,具有良好的准确性(93.7%)和灵敏度(93.6%)

关键观点3: 该mNGS检测方法已用于检测多种样本类型的感染诊断,并经过实验室验证。

其性能评估包括对线性、灵敏度、特异性和准确性的测试,证明其可以有效检测呼吸道样本中所有已知及新型病毒病原体。

关键观点4: 研究团队还探讨了病毒载量浓度与感染严重程度之间的相关性,观察到病毒载量浓度随着病症加重而增加。

这项发现对预测疾病的进展和病毒传播具有重要意义。

关键观点5: 该mNGS检测方法已经获得FDA突破性设备认定,证明了其在临床和公共卫生实验室进行常规检测的可行性。

该研究的成果有助于为病毒大流行做出强有力的快速反应。


文章预览

呼吸道感染是全球最常见的感染之一。由于潜在病原体的多样性,由病毒引起的呼吸道感染尤其难以诊断。近年来,新出现的大流行病毒是一种不可预测的健康威胁,而核酸扩增试验等传统工具并不能检测到这类病毒。当前亟需可快速识别新型和/或新发病毒的工具,以应对不明原因感染的临床诊断并为病毒大流行做准备。 新一代宏基因组测序(mNGS)是一种全面且无偏倚的诊断方法,颇具临床应用前景,可用于鉴定不明原因感染的病原体;无需特定引物和探针,只需一次检测即可鉴定所有潜在病原体。目前,mNGS已广泛用于多种样本类型的感染诊断,但由于成本高、方案复杂、缺乏自动化、周转时间过长和灵敏度较低等局限,其在临床微生物学实验室的普及中受到阻碍。 近日,美国加州大学旧金山分校的科研人员在 Nature Communications 发表了题为“Lab ………………………………

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