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写在前面 不知为何,几乎每天我都会收到一些「基因家族分析」的论文审稿邀请,其中质量参差不齐,但有不少论文作者团队非常友好,总是留下一个非常好提问机会。那就是「基因家族成员序列有问题」这意味着, 得重做 。对于一个以「基因家族分析」为主题的工作来说,往往相关表格和图片都得重新来。如果不小心,用了错误的基因序列做功能验证,那更是白费一年时间。 当然,对于审稿人不小心的情况,也比比皆是。简单通过 google scholar 搜索,可以很快找到一大堆 已发表的论文 ,从主图来看,有经验的审稿人一眼就看出问题。这个错误的责任,20%归结于发布基因组的人,更有80%归结于进行基因家族鉴定工作的人。后者,我觉得还是要精细一些。 几个示例 上图由于串联重复基因被注释成一个,从 motifs pattern 就可以看出来问题。 图片得
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