4+单基因新思路，搭配实验验证，轻轻松松就可以拿下！

文章预览

‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ PVALB Was Identified as an Independent Prognostic Factor for HCC Closely Related to Immunity, and Its Absence Accelerates Tumor Progression by Regulating NK Cell Infiltration ”，这篇文章发表在 J Hepatocell Carcinoma 期刊上，影响因子为4.3。 结果： PVALB被鉴定为HCC患者中与NK细胞相关的关键基因 为了筛选能够影响肝细胞癌进展的关键基因，作者进行了一系列研究。主要基于TCGA中的所有基因表达数据，以及GSE54236与HCC相关的数据集，作者进行了差异表达分析，如火山图 1A–B，两个队列中分别有 12,471 和 9395 个 DEG。随后，使用 MCP 计数器算法，作者计算了两个队列中浸润免疫细胞中的所有 DEG 的丰度。有趣的是，结果显示，大多数免疫细胞，特别是NK细胞在肿瘤微环境中以高丰度浸润（补充图1A和D），这邀请作者利用WGCNA方法，将适应性免疫反应和NK细胞 ………………………………