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7+线粒体+分型+预后模型+实验验证的“干湿结合”生信思路!还不赶紧上车?

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-06-17 10:16

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“MTFR2-dependent mitochondrial fission promotes HCC progression”,这篇文章发表在J Transl Med期刊上,影响因子为7.4。 HCC中线粒体基因的特征 在23个线粒体动态基因中,与正常组织相比,21个基因(DNM1L,MTFR2,ARL2,MFN1,MIGA1,MIGA2,MTCH2,OMA1,OPA1,PLD6,ARMC10,FIS1,MFF,MIEF1,MIEF2,MTFP1,MTFR1,MUL1,RAB24,SLC25A46,SPIRE1)在HCC组织中显著上调,其表达水平的热图显示在图2A中。DEGs的共表达网络显示MTFR2和DNM1L的表达水平呈正相关(图2B)。此外,这些21个DEGs编码的蛋白质之间的相互作用显示在图2C中。 线粒体动态基因的共识聚类鉴定出两个肝细胞癌患者群集,具有不同的病理特征、线粒体状态和临床预后 根据已知动态基因的表达,当k = 2时观察到了最“清晰”的聚类(图3A-H)。当k = 2时,聚类内组间相关性最高,组间干扰最 ………………………………

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