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组合拳!“孟德尔随机化+转录组学”绝配!纯生信3张图交出7+答卷!经典永不过时,还不赶快冲冲冲!

生信图书馆  · 公众号  ·  · 2024-09-11 19:00

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最近不少小伙伴吐槽,0实验生信文章太难发啦~哎~别急,纯生信文章不是不好发,大概率是研究不够完整、缺乏验证,或者是 选题缺乏创新等原因( PS:如果不清楚自己的文章问题具体出在哪里,可以找馆长帮你评估一下! )。今天馆长通过一篇近期刚发表的经典生信文带大家捋一下思路。 孟德尔随机化(MR)的火热程度不用馆长再多说了吧,不少宝子通过馆长已经尝到了“甜头”。那再搭配上经典的转录组学,又会擦出怎样的火花呢? 这是来自中医科学院谢雁鸣团队的SCI,作者首先利用 双样本MR 评估不同风险因素与缺血性中风之间的因果关系,然后进行 共定位 分析探究其共享的遗传机制;随后,利用GEO数据集进行 差异分析 、 免疫浸润 分析,通过 机器学习 筛选关键基因,构建 列线图模型 ;最后,使用 验证集 验证了上述结果。 文章思路 ………………………………

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