GEO已成过去式？顶刊的非肿瘤纯生信现在流行用这个数据库！结合机器学习+多组学，小小Nat Commun，拿捏~

文章预览

说到非肿瘤纯生信研究的数据库，大家是不是首先想到的就是GEO？不得不说这个数据库那真是相当好用，无论是非肿瘤、肿瘤、表达谱芯片、转录组、单细胞……所有你能想到的数据，在这里几乎都能找到，主打一个拿别人的数据，发自己的文章！对于肿瘤研究除了GEO，我们最常用的就是TCGA了，那么非肿瘤研究除了这个数据库，还有什么数据库能用呢？今天小塔就大家隆重介绍一下这个可用于非肿瘤生信分析的数据库—UK Biobank（简称UKB）。 近日，诺和诺德牛津研究中心基于UKB数据库，通过使用 可解释的机器学习方法 ，来识别和预测亚组骨关节炎的风险生物标志物。文章涉及的临床数据完全来自UKB，而且 还整合了 基因组学、蛋白组学和代谢组学 数据，展示了一个从数据收集、模型开发、到风险生物标志物识别的完整分析流程，具有重要的临床 ………………………………