​硫铵-π、铵盐−π和硫−π相互作用的比较

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本研究结合理论计算和PDB数据库分析，在设计的β发夹 (Beta hairpin) 模型系统中研究了硫铵-π（Sulfonium−π）、硫-π（Sulfur−π）和铵盐-π（Ammonium−π）相互作用。结果表明三种类型的相互作用中硫铵-π相互作用是最强的，硫铵的极化率对相对于铵盐而言也更强。三甲基硫铵基与三甲基铵盐基团的溶剂化差异也有助于更强的磺胺基-π相互作用。比较蛋白质中的硫铵-π与硫-π相互作用，在PDB中对结合了SAM和SAH的酶进行分析表明，芳香族残基富集在SAM和SAH的硫原子附近，但两种辅酶的芳香相互作用的特征并没有显著不同，除了SAM中的甲基-π相互作用，这是SAM中最常见的相互作用，但在SAH中不可能发生。这表明，由于从SAM到SAH过程中失去阳离子-π相互作用而导致的较弱相互作用能量可能有助于辅酶的周转。 背景 阳离子-π相互作用被定义为阳离子物种与芳香 ………………………………