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12+肠道菌群+孟德尔随机化,5种MR分析结合,换个疾病也能轻松发文!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-08-01 18:20

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ Gut microbiome and frailty: insight from genetic correlation and mendelian randomization ”,这篇文章发表在 Gut Microbes. 期刊上,影响因子为12.2。 结果: LDSC回归分析 作者进行了LDSC回归分析,评估了119个属水平的肠道微生物与衰弱之间的遗传相关性。由于遗传力和样本量较低等限制,一些属无法用于上述分析。最终,作者得到了61个属与衰弱之间的遗传相关性估计。如表1和图3所示,LDSC显示Christensenellaceae R-7与衰弱之间存在暗示性相关性(r g = −0.212,p = 0.047)。有关所有遗传相关结果的详细信息列在表S1中。 MR分析 根据筛选标准,选择了1132个SNP作为119个属水平肠道微生物的工具变量(IVs)。所有选择的IVs的F统计量均大于10,表明存在较小的弱工具偏倚可能性。所有选择的IVs的详细信息见表S2。至少有两种MR方法(表2和图4、5 ………………………………

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