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RT-PCR 引物的选择

生物学霸  · 公众号  · 生物  · 2025-01-01 12:16
    

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随机引物 适用于长的或具有发卡结构的 RNA。适用于 rRNA、mRNA、tRNA 等所有 RNA 的反转录反应。主要用于单一模板的 RT-PCR 反应。 Oligo dT 适用于具有 PolyA 尾巴的 RNA。(原核生物的 RNA、真核生物的 Oligo dT rRNA 和 tRNA 不具PolyA 尾 巴。)由于 Oligo dT 要结合到 PolyA 尾巴上,所以对 RNA 样品的质量要求较高,即使有少量降解也 会使全长 cDNA 合成量大大减少。 基因特异性引物 与模板序列互补的引物,适用于目的序列已知的情况。天为时性引物代公司的 SuperScript One-Step System 特别适合于与基因特异性 引物连用。 PCR 扩增后出现的条带与预计的大小不一致,或大或小,或者同时出现特异性扩增带与非特异性扩增带。 原因 建议 引物 引物特异性差 重新设计引物,改变引物的位置和长度,增强其特异性或使用 巢式 PCR 引物浓度过高 适当减少引物浓度 Mg2+ 浓度 Mg2+ 浓 ………………………………

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