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成纤维细胞其实在TME(肿瘤微环境)中,也是一个举足轻重的存在,所以夏老师在PubMed上冲浪的时候,就看到了这么一篇中山大学中山纪念医院发表在48.8分的Cell子刊Cancer Cell上的文章。可以看得出来,这篇文章的工作量是巨大的: 他们研究的是BCa(膀胱癌)的LVI(淋巴血管浸润)和LN(淋巴结)转移,其实他们第一步还是从筛选开始的,首先他们通过单细胞测序,分析了BCa中LVI与LN转移相关的细胞簇( 下面的UMAP图相信大家应该能看懂了,这个在《夏老师带你读文献》和《列文虎克读文献》里也都讲过,就是多主成因的降维图形,来分析单细胞测序情况下的不同细胞分簇,每个分簇其实代表了一个转录组相近的一个细胞簇 )。结果发现BCa中LVI与LN转移样本中,CAFs(成纤维细胞)变化极大(下图的蓝框),而对CAFs进行再进一步分析后发现BCa中LVI与LN
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