Science新登，David Baker团队用AI从头设计栩栩如生的酶，比同类设计好6万倍

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将 ScienceAI   设为 星标 第一时间掌握 新鲜的 AI for Science 资讯 编辑 | 萝卜皮 科学家使用人工智能（AI）从头设计酶的研究往往收效甚微，产生的酶通常在反应的第一步后就会停止。设计具有复杂活性位点并介导多步反应的酶仍然是一项艰巨的挑战。 以丝氨酸水解酶为模型系统，华盛顿大学 David Baker 团队将 RFdiffusion 的生成能力与用于评估活性位点预组织的集成生成方法相结合，从最小活性位点描述开始设计酶。 实验表征表明催化效率（kcat/Km）高达 2.2x10^5 M^−1 s^−1，晶体结构与设计模型非常吻合（Cα RMSDs < 1 Å）。 通过选择反应坐标中的结构兼容性，可以在低通量筛选中识别出具有五种不同折叠的新催化剂，这些折叠与天然丝氨酸水解酶的折叠不同。 他们设计的酶加速了四步化学反应，而这一反应对许多生物和工业过程至关重要，包括塑料回 ………………………………