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*仅供医学专业人士阅读参考 血浆表观基因组分析助力精准诊断异位肾癌 异位肾细胞癌(tRCC)是一种侵袭性肾癌亚型,通常由涉及TFE3基因的融合驱动。由于与其他肾细胞癌(RCC)亚型的组织学特征存在重叠,tRCC经常 被错误分类。因此,迫切需要开发准确诊断这种分子特征独特的疾病的方法。最近,通过血浆染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)对循环肿瘤DNA(ctDNA)进行表观基因组分析已成为检测和分子分型癌症的强大工具,并可能为实现 分子融合的更敏感和特异性检测提供可能。本研究 [1] 旨在通过 cfDNA的表观基因组分析,在血浆中检测tRCC,并将tRCC与肾透明细胞癌(ccRCC)区分开来。 研究方法 通过RNA-seq、甲基化DNA免疫沉淀测序(MeDIP-seq)和ChIP-Seq,对4个tRCC和5个ccRCC细胞系进行了特异性于tRCC与ccRCC的差异表达基因、甲基化区域和调控元件(REs)的鉴
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