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组学分析显示两个基因表达强相关,怎么就是验证不出调控关系呢?

猫头鹰教室  · 公众号  ·  · 2025-02-19 11:00
    

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在国自然项目和文章中,为了证明基因 A 对基因 B 的调控,我们一般都会分析一下基因 A 与基因 B 之间的表达相关性, 如果结果显示基因 A 与基因 B 之间存在显著强相关性( P < 0.05 ,一般相关系数的绝对值需要大于 0.3 ),这个相关性的数据可以作为 A 调控 B 表达的一个支持性证据: 当然,基于 A 调控 B 表达的假说,也可以一开始从数据分析进行筛选,而相关性分析一般也是其中一个筛选的指标, 然后基于相关性就可以初步筛选可能调控基因 B 的候选基因 A 了。 当然,在后续实验验证(比如把 A 沉默、过表达、抑制或者激活后检测基因 B 的表达)的时候就会出现题目中的问题: 虽然基因 A 与基因 B 表达上呈现强相关,但是怎么都验证不出来基因 A 对基因 B 的调控关系。 我们假定实验结果没有问题,即基因 A 沉默后确实没有影响基因 B 表达,然 ………………………………

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