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论做kegg富集分析时的困难七十二变……

SCIPainter  · 公众号  ·  · 2024-08-24 11:00
    

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打开omicshare在线工具网页,众目睽睽看到kegg富集分析工具一直稳居首页热度top3,少有人知的是这背后也有众多使用者、开发人员共同历经“九九八十一难”不断发现问题、优化升级工具,不断提升用户使用体验的功劳。今天给大家分享的就是“热度王”kegg富集分析工具在使用过程中的常见问题,新手小白可直接收藏避坑~ 常见报错原因 1. 选用平台背景基因分析时,目的基因文件使用的gene name、NCBI ID等基因ID类型导致报错,需要转换成ensemble ID;可使用 基因ID转换工具 进行转换; 2. ensemble ID带有版本号报错,如ENSG00000121410.11,即小数点及后面的数字需删除; 3. 物种及版本选错,平台自带18种模式物种的ensemble ID背景基因及多种版本,需选择目的基因对应的正确的物种,并尽量选择最新的版本,包含更多信息; 4. 自行准备背景基因文件: 1)背景基 ………………………………

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