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有时候咱们真的没有充分挖掘scTCR的数据,看看这篇 NC怎么与转录组融合的-生信代码

生信钱同学  · 公众号  ·  · 2024-07-04 07:15
    

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不设置🌟有时会收不到公众号内容,code一段时间后会失效 需要的小伙伴们请及时到 文末 领取今日的code mvTC R模型简介( 先看看这个能干嘛),怎么充分利用 TCR数据 mvTCR是一种基于深度变分自编码器(Variational Autoencoder, VAE)的生成模型,旨在将TCR和转录组信息融合到一个共享表示中。具体来说, mvTCR接收每个细胞的基因表达数据和TCR的α链和β链的氨基酸序列(充分融合了, 之前大家做 TCR分析的时候都是单独分析的,几乎不考虑 RNA表达的情况 ) 。通过嵌入这些信息,该模型生成一个低维表示,从而捕捉到抗原特异性和细胞状态的信息。 mvTCR的创新点和优势 多模态数据融合 :传统的scTCR分析方法通常将TCR数据和转录组数据分别处理,可能忽略两者之间的重要联系。而mvTCR能够将TCR和转录组数据融合到一个共享表示中,从而捕捉到更多的细胞功能 ………………………………

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