主要观点总结
该文章探讨了癌症中核糖体生成相关的基因标志物和治疗靶点。文章通过对多种癌症类型的数据进行综合分析，提出了评估核糖体生成活性的算法，并探究了核糖体生成异常活跃与肿瘤诊断与预后的关系。此外，文章还分析了核糖体生成相关基因的DNA水平改变，并评估了这些基因作为药物靶点的潜力。最后，文章从已知抗癌药物中筛选了可能通过抑制核糖体生成来治疗癌症的药物。
关键观点总结
关键观点1: 文章提出了评估核糖体生成活性的算法。
该算法基于转录组数据，通过GO富集分析、ssGSEA等方法开发，可用于评估不同癌症组织中核糖体生成的活跃程度。
关键观点2: 文章发现癌症中核糖体生成异常活跃与肿瘤诊断与预后有密切关系。
通过AUC曲线等分析方法，证明了核糖体生成的活跃程度可以明显区分肿瘤组织和非肿瘤组织，并且核糖体生成评分高的病人生存率较低。
关键观点3: 文章探究了核糖体生成相关基因的DNA水平改变。
通过CNV分析等方法，发现人类癌症中核糖体生成相关基因的CNV比例较高，并且存在一些反复扩增的RiboSis基因。
关键观点4: 文章评估了核糖体生成相关基因作为药物靶点的潜力。
虽然目前只有两个核糖体生成相关基因作为治疗靶点，但大量对于癌症生长至关重要的核糖体生成相关基因具有很大潜力。文章通过机器学习和关联分析等方法，预测了一些具有潜力的药物靶点。
关键观点5: 文章从已知抗癌药物中筛选了可能通过抑制核糖体生成来治疗癌症的药物。
通过对药物反应与核糖体生成基因表达量的关联分析，发现一些药物与核糖体生成的抑制有关，这些数据为重新利用临床批准化合物通过抑制核糖体生成来杀死恶性细胞提供了宝贵资源。
文章预览
今天分享的文章于今年1月发表于杂志 Briefings in Bioinformatics（IF：6.8,Q1） ,基因集泛癌分析纯生信文章，研究方向： 核糖体生成 ，小伙伴们可留意这个方向哦 癌症中核糖体生成相关的基因标志物和治疗靶点 研究背景： 核糖体生成 是一个复杂的过程，包括rRNA转录、rRNA剪切、rRNA修饰、核糖体组装和前核糖体的输出， 涉及三种RNA聚合酶、大约80种核糖体蛋白和大约200种非核糖体转录作用因子。核糖体生成在细胞核仁开始，在细胞质中结束。核仁的大小和密度会根据蛋白质合成的需求发生变化，而核仁纤维蛋白的表达和RNA聚合酶I的丰度通常用于反映核糖体生物合成的活性。 在癌细胞中，参与核糖体生成的基因经常会发生突变，增加的癌变风险。 越来越多的证据表明，过度活跃的核糖体生成推动了肿瘤细胞生长和增殖，成为癌症发生和转移的核心因素
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