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准确率达0.96,从序列中预测蛋白-配体互作的物理化学约束图神经网络

ScienceAI  · 公众号  ·  · 2024-06-28 11:43

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将 ScienceAI   设为 星标 第一时间掌握 新鲜的 AI for Science 资讯 编辑 | 萝卜皮 在药物研发中,确定小分子配体对蛋白质的结合亲和力和功能效应至关重要。目前的计算方法可以预测这些蛋白质-配体相互作用特性,但如果没有高分辨率的蛋白质结构,通常会失去准确性,并且无法预测功能效应。 莫纳什大学(Monash University)和格里菲斯大学(Griffith University)的研究人员开发了 PSICHIC(PhySIcoCHemICal graph neural network), 这是一个结合物理化学约束的框架,可直接从序列数据解码相互作用指纹(fingerprints)。这使 PSICHIC 能够解码蛋白质-配体相互作用背后的机制,实现最先进的准确性和可解释性。 在没有结构数据的相同蛋白质-配体对上进行训练后,PSICHIC 在结合亲和力预测方面与领先的基于结构的方法性能相当,甚至超过了它们。 PSICHIC 的可解释指纹识别 ………………………………

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