tidyomics体系介绍及用法详解-4-tidySingleCellExperiment详解(1)

文章预览

教程首页 官网教程地址：https://stemangiola.github.io/tidySingleCellExperiment/articles/introduction.html 介绍 tidySingleCellExperiment提供了Bioconductor体系的单细胞包和tidyverse之间的桥梁。它允许将Bioconductor的SingleCellExperiment对象视为tidyverse tibble，并提供SingleCellExperiment兼容的dplyr、tidyr、ggplot2和ploly功能。这允许用户充分利用Bioconductor和tidyverse体系。 可用tidySingleCellExperiment功能和实用程序。 安装 if  (!requireNamespace( "BiocManager" , quietly=TRUE))     install.packages( "BiocManager" ) BiocManager::install( "tidySingleCellExperiment" ) 加载包 # Bioconductor single-cell packages library(scran) library(scater) library(igraph) library(celldex) library(SingleR) library(SingleCellSignalR) # Tidyverse-compatible packages library(purrr) library(GGally) library(tidyHeatmap) # Both library(tidySingleCellExperiment) # Other library(Matrix) library(dittoSeq) tidySingleCellExperiment ………………………………