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增强子研究技术总结

科研这点事儿  · 公众号  ·  · 2024-07-07 06:53

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根据增强子的研究角度将这些研究手段分为两大类:① 增强子及其活性鉴定 ,这些技术包括 染色质免疫共沉淀测序(chromatin immunoprecipitation sequencing,ChIP⁃seq) , 核酸酶靶向切割与释放(cleavage under targets and release using,CUT ) 以及 利用转座酶检测染色质可及性测序(assay for transposase accessible chromatin with high⁃throughput sequencing,ATAC⁃seq)技术 , 大规模并行报告基因检测(massively parallel reporter assay,MPRA) 和 自转录活性调控区域测序 (self⁃transcribing active regulatory region sequencing, STARR ⁃seq) , 新生RNA测序(global nuclear run⁃on sequencing,GRO⁃seq)等 ;② 增强子的靶基因鉴定及其功能研究 ,这些技术包括 染色质构象捕获 (capturing chromosome conformation,3C) 及其衍生技术 , CRISPR⁃Cas9 和 CRISPR⁃dCas9 等。 1. 分析鉴定增强子及其活性的方法 随着对增强子 ………………………………

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