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实用干货 | 转录组还能有这么多问题?

基迪奥生物  · 公众号  ·  · 2024-08-28 18:00
    

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什么是转录组测序?转录组测序简称RNA-seq,是一种高通量技术,用于分析细胞或者组织在特定条件下的RNA分子组成,换句话说,RNA-seq是对某个条件下生物体的转录状态拍了一张快照。通过这种技术,研究人员可以了解基因表达的模式,包括哪些基因被激活或抑制,以及它们的表达水平如何变化。 近年来,随着测序成本的不断降低,RNA-seq已经成为生物学研究必不可少的技术手段,从标准的RNA-seq流程中也衍生出100多种应用,已经广泛地应用在临床和基础研究中,但是对于大多数初学者来说,RNA-seq的分析结果中依旧暗藏很多问题。 01 RNA-seq是如何测出我们基因的表达量的? 从研究样本中提取总mRNA并进行建库和测序,对获得的下机数据进行质量控制,选择合适的比对工具将处理后的reads比对到参考基因组上,最后,使用工具从比对结果中提取每个基因 ………………………………

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