主要观点总结
本文介绍了一种基于RNA语言模型的深度学习方法RhoFold+，用于准确、快速地进行从头预测RNA三维结构。该方法通过集成在约2370万个RNA序列上预训练的RNA语言模型，解决了数据稀缺问题，为RNA 3D结构预测提供了完全自动化的端到端流程。RhoFold+在单链RNA建模方面表现出很高的准确性，并能够捕捉局部特征。相关研究发现，RhoFold+优于现有方法，为RNA靶向药物开发和合成生物学设计提供了重要信息。
关键观点总结
关键观点1: RNA 3D结构预测的重要性及挑战
RNA分子的构象灵活性使得实验确定其3D结构具有挑战性。准确预测RNA 3D结构对于理解其功能以及为RNA靶向药物开发和合成生物学设计提供信息至关重要。
关键观点2: RhoFold+的方法与优势
RhoFold+是一种基于RNA语言模型的深度学习方法，通过集成预训练的RNA语言模型和解决数据稀缺问题，实现了准确、快速的RNA 3D结构预测。它在单链RNA建模方面表现出很高的准确性，并能够捕捉螺旋间夹角（IHA）和二级结构等局部特征。
关键观点3: RhoFold+的性能评估
RhoFold+在CASP15天然RNA靶标上显示出最佳结果，并在RNA-Puzzles结构中实现了低于4 Å的平均均方根位移。其效率高，只需0.14秒即可生成准确的预测，无需耗时的采样或依赖专家知识。
关键观点4: RhoFold+的应用前景与局限性
RhoFold+在RNA研究领域具有广泛应用前景，尤其在加速RNA结构的识别和功能理解方面。然而，它仍面临一些局限性，如依赖于MSA，难以预测大型复杂的RNA结构以及模拟RNA与配体或蛋白质的复合物等。
文章预览
RNA 分子在分子生物学中心法则中起关键作用，RNA 结构如何影响基因调控和功能一直是研究的热门话题。准确预测 RNA 三维 (3D) 结构仍是一个难题。RNA 的结构灵活性导致实验确定的数据稀缺，从而使计算预测工作变得复杂。 在此，香港中文大学、复旦大学、哈佛大学、智峪生科（Zelixir）等多机构团队合作， 提出 一种基于 RNA 语言模型的深度学习方法 RhoFold+，用于准确、快速地进行从头预测 RNA 三维结构。 通过集成在约 2370 万个 RNA 序列上预训练的 RNA 语言模型，并利用技术解决数据稀缺问题，RhoFold+ 为 RNA 3D 结构预测提供了完全自动化的端到端流程。 RhoFold+ 在单链 RNA 建模方面表现出很高的准确性，在 RNA 家族和类型之间具有出色的泛化能力，同时还能够捕捉螺旋间夹角（IHA）和二级结构等局部特征。 对 RNA-Puzzles 和 CASP15 天然 RNA 靶标的回顾性评估
………………………………
