专栏名称: 生信分析手册
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生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-06-22 14:46

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ Identification of m6A-Related Biomarkers in Systemic Lupus Erythematosus: A Bioinformation-Based Analysis ”,这篇文章发表在 J Inflamm Res. 期刊上,影响因子为4.5 。 结果: SLE患者与健康对照组之间的差异基因鉴定 在对四个微阵列(GSE50772、GSE61635、GSE72509和GSE81622)进行的回顾性分析中,共评估了289个SLE患者样本和93个HC样本。利用limma R软件包进行批次效应消除后,从元数据中确定了171个差异表达基因(DEGs):在SLE患者样本中,有86个基因明显上调,85个基因明显下调(图2A和B)。 功能富集分析 R中的clusterProfiler包被用于对171个鉴定的差异表达基因(DEGs)进行GO和KEGG分析。研究结果显示,这些差异表达基因主要参与了对病毒、囊泡腔和嗅觉受体活性的响应(图2C)。此外,KEGG分析揭示了几个显著的信号通路,包括嗅觉转导、冠状病毒 ………………………………

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