孟德尔随机化联合共定位分析，轻松拿5+，简直不要太舒服！

文章预览

‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ Causal effect of gut microbiota on pancreatic cancer: A Mendelian randomization and colocalization study”，这篇文章发表在 J Cell Mol Med 期刊上，影响因子为5.3。 结果： GM与PC之间的因果关系 总共包括211种含有14,581个SNP（p < 1.0e‐5）的GM。根据IVs选择和局部聚集（LD，r^2 < 0.01，窗口= 5000 kb）的原则，作者确定了2769个SNP作为IVs。最后，作者发现了与PC有因果关系的9种GM（总共98个SNP），其中包括4种保护性GM和5种风险相关GM（图2）。每个相关SNP对结果的影响如图3所示。详细信息请参见表S2，IVs的F统计量在19.07至31.12之间（表S3），均超过10。Cochrane's Q检验和IVW和MR Egger的I^2显示这些IVs没有显著的异质性（Cochrane's Q > 0.05，I^2 < 0.05；表S4和表S5），MR-Egger回归截距分析未发现水平多效性（表S6）。Steiger检验显示没有逆向因果影响（表S7） ………………………………