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Aging (Albany NY) | 肝细胞癌骨转移相关新基因拓扑异构酶2A的鉴定

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2025-02-24 18:00
    

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇文章“ Identification of topoisomerase 2A as a novel bone metastasis-related gene in liver hepatocellular carcinoma ”,这篇文章发表 在 Aging (Albany NY) 期刊上,影响因子为3.9。 结果: TOP 2A与LIHC骨转移相关 从GSE 27635数据库中检索48例LIHC患者的匹配肿瘤和瘤周组织的mRNA表达数据和临床数据,其中包括24例骨转移(BM)患者。首先,火山图显示了48个肿瘤和肿瘤周围组织之间的DEG(图1A)。同时,分别显示了有或无BM的LIHC患者与其对应组织之间的DEG。有趣的是,TOP2A、BIRC 5和斯马卡都显著上调,而NAT2、PLG和ESR1显著下调。其中,TOP2A的上调在3组中最为显著。此外,图1B、1C显示,在有和没有BM的LIHC患者之间,总共46个基因具有差异表达。接下来,作者使用维恩图(图1D)来鉴定与来自LIHC和癌旁组织的上述DEG以及来自BM和非骨转移(NBM)LIHC的DEG重叠的BM ………………………………

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