Nat Commun | 成功率达90%！生物信息学聊天机器人DrBioRight 2.0上线，引领癌症蛋白质组学研究新范式

文章预览

过去十年间，得益于癌症基因组图谱（TCGA）和癌细胞系百科全书（CCLE）等计划的推动，癌症组学取得显著发展，特别是在肿瘤DNA和RNA层面，并生成了大量数据；但目前人们对肿瘤中蛋白质翻译及翻译后修饰（PTM）相关知识仍有待完善。反相蛋白质微阵列（RPPA）技术可对癌症样本进行大规模功能蛋白质组学数据分析，提供了对癌症机制的重要见解，有助于发现新型生物标志物和治疗靶点。 近日，美国 德克萨斯大学 MD安德森癌症中 心 梁晗 团队 利用 RPPA 技术， 分析了 8 , 000 份 TCGA 患者肿瘤样本和 900 份 CCLE 细胞系样本， 构建了 一个全面 、高质量的 的 泛癌 功能蛋白质组学 数据库 RPPA500 ， 包括近 500种高质量抗体，涵盖所有主要癌症标志通路。 为提高该资源可访问性和分析能力， 同时推出了 一个由 先进 大语言模型（ LLMs）驱动的直观生物信息学 ………………………………