专栏名称: 生信人
共同学习生物信息学知识,共同探究生物奥秘。
今天看啥  ›  专栏  ›  生信人

经费不够?方法来凑!类器官疾病模型研究只需一次单细胞测序

生信人  · 公众号  · 生物  · 2024-12-31 16:02
    

文章预览

利用 iPSC 构建疾病类器官模型具有广阔的应用前景,单细胞测序技术( scRNA-seq )对于揭示类器官的异质性、不同细胞亚群间相互作用具有无可替代的作用。然而,相对传统测序( bulk RNA-seq ),其花费也高很多,尤其是需要对多时间点多组别进行测序时, scRNA-seq 在经济上显然是不可行的。近日,一篇 Nat Commun 的文章提出了一个 Vireo-bulk 方法,该方法联合多个 bulk RNA-seq 和 单次 scRNA-seq 数据即可有效的对类器官动态变化进行分析。 同时,作者构建了肾脏嵌合类器官疾病模型,进行了 1 次 scRNA-seq 和 5 次 bulk RNA-seq ,对该方法进行了验证。 一、背景 在构建类器官疾病模型时,细胞可能源于患者、健康人或一些细胞系。来源的不同会导致类器官疾病模型的批次差异,同时实验操作会进一步放大这种误差。样本多重分析,也称为多重测序,通过混合已标 ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览