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Nature Methods | 解码基因调控新机制:系统性发现人类转录组中的RNA结构开关

生物探索  · 公众号  · 生物  · 2024-07-17 17:23
    

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引言 RNA结构开关(RNA structural switches)是基因表达的重要调控因素,广泛存在于细菌中。然而,在真核生物中,RNA结构开关的研究和鉴定却相对有限。 在细菌中,一些RNA开关被称为核糖开关(riboswitches),它们通过结合小分子配体诱导RNA构象变化,从而控制基因表达。尽管植物和真菌中已鉴定出一些硫胺素焦磷酸感应核糖开关,但在人类中已知的RNA开关仅有两个: 一个是依赖于蛋白质的血管内皮生长因子A(VEGFA)RNA开关,另一个是基于m6A修饰的RNA开关 。因此,RNA开关在高等真核生物基因表达中的总体影响仍不清楚。 7月16日 Nature Methods 的研究报道“ A systematic search for RNA structural switches across the human transcriptome ”介绍了 SwitchSeeker,一种综合计算和实验方法,用于系统鉴定功能性RNA结构开关 。研究人员将SwitchSeeker应用于人类转录组,并识别出245个潜 ………………………………

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