细胞通讯CellChat工作原理及应用思路

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上期我们介绍了CellphoneDB原理和应用思路，具体可查看 《先收藏！史上最详细的细胞通讯CellphoneDB原理和应用思路》 ，本期我们继续介绍细胞通讯分析的另一个软件CellChat原理及应用思路。 本期内容主要介绍CellChatDB数据库详情、CellChat算法原理、CellChat的应用思路。 一、CellChatDB数据库详情 01 数据库总览 CellChatDB是手工整合的配体、受体及其复合体、辅助因子的互作关系数据库，其中辅助因子包含配体激活剂、配体拮抗剂、受体共刺激分子、受体共抑制分子。 CellChatDB来源KEGG pathway数据库的信号相互作用信息和实验研究的文献。官方配置人、小鼠、斑马鱼的数据库。此外，CellChatDB还有配受体对的通路、功能注释、疾病、亚细胞定位、是否跨膜、神经递质的相关信息。 图1 CellChatDB数据库详情 02 数据库生成原理 CellChatDB主要来自KEGG pathway数据库，从下 ………………………………