干货分享 | 相关性组合图绘制

文章预览

写在前面 本公众号之前推送过关于 怎么使用mantel检验的绘图形式绘制普通相关性 （pearson、spearman之类的） 的 推文 ， 但存在不完善的地方，需要大家手动整理相关性的结果。本篇推文为升级版代码，能够实现一键出图。 准备数据集 数据如下，小编已上传，文末下载。 直接开始绘图 我们只需要提及几个小细节，这里我们记住第11行代码，这里是选择自己绘图的目标因子的，想选择几个都可以。 # 加载所需库 library(Hmisc) library(dplyr) library(linkET) library(ggplot2) # 读取数据 df TRUE , row.names = 1 ) # 提取目标因子和环境因子 target_factors "AGB" , "BGB" ) env_factors 后面的代码大家直接运行，备注已写明每个细节需要如何调整。 # 分离环境因子数据 env # 计算相关性矩阵和 P 值矩阵 df_rcorr type = "pearson" ) r $r # 相关系数矩阵 p $P # P 值矩阵 # 初始化结果数据框 resul ………………………………