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科研技能 | 使用ImageJ测量叶片面积和周长

走天涯徐小洋地理数据科学  · 公众号  ·  · 2024-08-22 18:00

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写在前面 叶片是植物进行光合作用和蒸腾作用的主要器官,其形态特征受水分、光照、温度等环境因子的重要影响。叶面积是叶片形态特征或叶片功能性状中最重要的指标之一,本期教程将为大家介绍如何使用学界认可度很高的ImageJ软件测量叶面积。此外,本教程也会提到如何测量叶片周长等软件内置的指标。 1 材料准备 1.1 叶片样品的收集与扫描 在测量叶面积等指标前,我们需要使用扫描仪获得叶片的扫描图像,通常情况下,扫描的图像尺寸和dpi是我们可以自行设定的。 这里的示例用到的是n片阿尔泰狗娃花的叶片扫描成的tiff图像,分辨率为为600 dpi,文件大小约为54MB。 值得一提的是,600dpi意味着1 inch 2 的面积中有600个像素单位,而1 inch = 2.54 cm。 由此我们不用在扫描仪上放置标尺也可以计算图像(已知分辨率)对应的实际尺寸。 图1. 示例植物 ………………………………

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